Cornelis Stooter maakte snel naam als zeeschilder in Leiden en hij had contact met de bekende zeeschilder Jan Porcellis. Volgens het stadsarchief verkocht Stooter in 1629 een stuk grond en een huis aan de welgestelde Porcellis. De vraag is echter of hij een leerling van deze meester was, want daar ontbreekt duidelijk bewijs. Cornelis Stooter was halverwege de 17e eeuw een belangrijke figuur in de kunstscène in Leiden. Hij was een van de oprichters van het beroemde Sint-Lucasgilde in 1648 en bekleedde verschillende keren de functie van meester en diaken. Cornelis Stooter stierf op 4 september 1655 en werd begraven in de Pieterskerk te Leiden. Cornelis Stooter had een zoon, Leonard Cornelisz Stooter, die landschapsschilder werd. Hij werd in 1656 ingeschreven in het Gilde van Antwerpen en stierf daar in 1692.